Родился 15 января 1919 года в селе Гинта Акушинского района Республики Дагестана в семье крестьянина. Даргинец. Образование начальное. Работал в колхозе.

В Красной Армии с 1941 года. На фронте в Великую Отечественную войну с января 1942 года. Принимал участие в освобождении Польши, в боях на территории Германии, в штурме Берлина.

Огнеметчик 19-го отдельного огнеметного батальона (8-я гвардейская армия, 1-й Белорусский фронт) сержант Хизри Магомедов 10-17 августа 1944 года в районе населенного пункта Студзянка (Польша) на левом берегу реки Висла участвовал в отражении шестнадцати контратак врага и уничтожил из огнемета свыше двадцати солдат противника.

За мужество и отвагу, проявленные в боях, сержант Магомедов Хизри Магомедович 7 сентября 1944 года награждён орденом Славы 3-й степени (№ 199850).

Командир отделения того же батальона старшина Хизри Магомедов 1 февраля 1945 года близ города Познань (Польша) под огнем скрытно подполз к вражеской самоходной артиллерийской установке, из огнемета поджег ее, в бою из автомата уничтожил около десяти гитлеровцев.

За мужество и отвагу, проявленные в боях, старшина Магомедов Хизри Магомедович 29 марта 1945 года награждён орденом Славы 2-й степени (№ 4861).

28 апреля 1945 года в бою за столицу фашистской Германии - город Берлин при отражении одной из контратак Хизри Магомедов с отделением уничтожил более двадцати солдат противника и многих захватил в плен.

Указом Президиума Верховного Совета СССР от 31 мая 1945 года за образцовое выполнение заданий командования в боях с немецко-фашистскими захватчиками старшина Магомедов Хизри Магомедович награждён орденом Славы 1-й степени (№ 570), став полным кавалером ордена Славы.

В 1945 году стал членом ВКП(б)/КПСС. После войны некоторое время продолжал службу в Вооруженных Силах СССР. В 1946 году Х.М. Магомедов демобилизован.

Жил в городе Махачкала (Дагестан). Работал в колхозе. Скончался 11 января 1994 года.

Награжден орденом Отечественной войны 1-й степени, орденами Славы 1-й, 2-й и 3-й степени, медалями.